澳大利亚联邦（1901-1903）
1901年1月1日，澳大利亚各殖民区改制为州，组成澳大利亚联邦，成为大英帝国的联邦或自治领，归类为君主立宪制国家。这面国旗是1901年国旗设计大赛获胜作品，随后在墨尔本皇家展览馆的穹顶上首次升起。蓝底、左上角为英国国旗。蓝色体现环绕澳大利亚的大海。白色大六角星被称为“澳大利亚联邦之星”，其六个角代表澳大利亚的六个州，右边白色的五颗星则代表南十字星座，由里到外，逆时针方向依次是五角星、六角星、七角星、八角星、九角星。
澳大利亚联邦（1903-1908）
南十字星座改由四颗七角星和一颗五角星组成。
澳大利亚（1908至今）
巴布亚领地加入后，白色六角星改为七角星。
澳大利亚国旗上有三个突出的图案：英国国旗（表示其为英联邦一分子）、联邦之星和南十字星。米字旗被认为是象征澳大利亚曾经是英国属地的历史，也有观点认为此设计展示了对大英帝国的忠诚。联邦之星最初只有六个角，相当于澳大利亚六个同盟的属地。然而，在1908年，联邦之星增加了一个角，象征巴布亚领地（后来独立成为巴布亚新几内亚）和未来的领地。南十字星则是在南半球代表星座之一。
昆士兰州旗（1859-1870）
昆士兰州旗（1870-1876）
昆士兰州旗（1876-1901）
昆士兰州旗（1901--1963）
昆士兰州旗（1963至今）
新南威尔士州旗（1867-1870）
新南威尔士州旗（1870-1876）
新南威尔士州旗（1876至今）
维多利亚州旗（1870-1877）
维多利亚州旗（1877）
维多利亚州旗（1877-1901）
维多利亚州旗（1901-1953）
维多利亚州旗（1953至今）
南澳大利亚州旗（1870-1864）
南澳大利亚州旗（1864-1904）
南澳大利亚州旗（1904至今）
西澳大利亚州旗（1870-1953）
西澳大利亚州旗（1953至今）
塔斯马尼亚州旗（1875-1876）
塔斯马尼亚州旗（1876至今）
澳大利亚首都领地旗（1993至今）
北领地旗（1978至今）
圣诞岛旗帜（1986至今）
科科斯群岛旗帜（2004至今）
诺福克岛旗帜（1979至今）
澳大利亚南极领地（非官方旗帜）
豪勋爵岛（非官方）
原住民旗
托雷斯海峡居民旗
默里岛旗
赛贝岛旗
拳击袋鼠旗
一战捐款荣誉旗